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蕅益大师著作主要分释论与宗论两类。释论包括《阿弥陀经要解》、《金刚经破空论》、《般若心经略解》、《楞严经玄义、文句》、《楞伽经义疏》、《占察经义疏》、《法华经会义》、《佛遗教经解》、《佛说四十二章经解》、《八大人觉经略解》、《梵网经合注》、《菩萨戒本经笺要》、《起信论裂网疏》、《成唯识论观心法要》等经律论注疏。　　蕅益大师的著作主要收录在明《嘉兴藏》、《清藏》、日本《卍续藏》中。1989年，台湾佛教书局出版了《蕅益大师全集》，共二十二册，分为法藏指要、经释、律释、论释、文集、忏仪、杂著七个单元，这是迄今为止蕅益大师著作的极完整的单独结集。福建莆田广化寺等单位曾影印过该书，内部发行。　　《蕅益大师文集》中，基本依据《蕅益大师全集》的结构与编排，另外补充《全集》没有收录的《绝余编》，选编蕅益大师其重要、其具代表性的著作，以《蕅益大师全集》本为底本，以《嘉兴藏》、《清藏》、《卍续藏》本为校本，对原文采用现代标点、分段，希望能够为广大读者提供一个了解蕅益大师思想并由此进入佛法殿堂的优良读本。