作为物理学家，黄祖洽的杰出贡献主要可陈述为三点：第一，黄祖洽与导师彭桓武先生共同奠基和开拓了我国反应堆理论的研究。第二，黄祖洽是中国第一位同时参加和指导原子弹研制和氢弹研制的理论物理学家，在中国核武器事业中立下汉马功劳。第三，黄祖洽于1980年后从事教育事业，先后出版了《核反应堆动力学基础》、《输运理论》等经典教材，并为中国现代教育培养了诸多物理学杰出人才。作为知识份子，黄祖洽一生谦和低调，始终称自己还是个学生，职业生涯的前三十年致力于中国的国防事业，在核物理、统计物理、中子物理等领域取得了一系列科研成就。后三十余年，致力于教书育人事业，倡导“教学相长”，在非平衡态统计、输运理论以及凝聚态物理等领域取得了重要成果，培养了一批研究生和年轻的教学科研人员。