五卷《中国藏细菌战与卫生防疫档案》搜集了两岸藏档机构收藏的抗战时期传染病调查、卫生防疫和细菌战应对方面的档案，以及报刊中关于“细菌战”的各种报道，还包括1950年代中方对日本侵华战犯审讯材料，是迄今为止最为全面的相关资料集。这批史料涉及的内容和性质，大致分为行政管理、科普宣传、调查统计和预防救治四个方面，全方位地展示日军侵华过程中，进行细菌武器试验和实施攻击下，中国从中央到地方的应对之策，医疗卫生专业人员、官员和民众，以及外籍专家深入调查、组织预防、开展救治的过程。本卷围绕当时制定并颁布的卫生法律和行政条例，依照行政管理的内容，分别说明了中日双方围绕“疫”的攻防战带来的影响。