完善党委领导下的校长负责制，建立健全大学内部权力运行制约机制是治理时代大学面临的新命题。本研究对如何完善大学内部权力制约机制问题进行了深入分析和研究，遵循“主体—关系—机制”的研究思路，运用多案例与历史和比较研究的方法，以各个时期的典型高校为分析对象，从权力制约机制形成的历史维度和横向国际比较的维度分析了自中世纪大学以来和我国现代大学以来，大学内部权力制约机制形成的逻辑和运行的特点。对美国、英国、德国和日本高校内部权力制约机制运行现状和特点进行了比较分析。在调查研究的基础上，针对我国高校内部权力制约机制实际存在的问题和各类权力的性质与特点，从权力制约权力、制度制约权力、权利制约权力和文化制约权力四个方面有针对性地提出了完善的路径和建议。