《特种兵学校44谍战计中计》讲述了特种兵学校的队员们刚结束了一场反恐作战行动，剑齿虎却收到一条神秘短信：“游戏才刚刚开始……”到底是谁在暗中挑衅？很快，他们接到为一艘中国商船护航的命令，途中他们收到了来自预定航线外的求救信号。队员们决定兵分两路，分开不久后，他们得知中国商船并未遇险，求救信号竟是恐怖组织布下的陷阱。事情越来越蹊跷，仿佛他们的一举一动都被敌人清晰地监视着。队员们决定将计就计，揪出潜伏在他们身边的间谍。