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生命科学前沿及应用生物技术 代谢组学:方法与应用
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生命科学前沿及应用生物技术 代谢组学:方法与应用
许国旺 等
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序
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前言
绪论
1.1代谢组学简介
1.1.1代谢组学发展的时代背景
1.1.2代谢组学研究现状
1.1.3代谢组学与系统生物学
1.2代谢组学的研究方法
1.2.1样品采集与制备
1.2.2代谢组数据的采集
1.2.3数据分析平台
1.2.4代谢组学数据库
1.3代谢组学的应用
1.3.1药物研发
1.3.2疾病研究
1.3.3植物代谢组学
1.3.4微生物代谢组学
1.3.5代谢组学与中医药现代化
1.4代谢组学发展展望
参考文献
气相色谱-质谱技术在代谢组学中的应用
2.1气相色谱-质谱联用技术
2.1.1GC-MS的工作原理
2.1.3质谱谱图库
2.2基于GC-MS、GC×GC-TOFMS的代谢组学技术平台
2.2.1样品的采集与制备
2.2.2数据采集
2.2.4代谢物的结构鉴定
2.3代谢组学应用
2.3.1GC-MS在代谢组学研究中的应用
2.4发展与展望
参考文献
3.1液相色谱及液相色谱-质谱联用技术
3.1.1液相色谱
3.1.2液相色谱-质谱联用
参考文献
4.1超高效液相色谱的理论基础
4.1.1vanDeemter方程
4.1.2超高效液相色谱仪器
4.2超高效液相色谱与HPLC分析性能的比较
4.3超高效液相色谱在代谢组学中的应用
参考文献
5.1毛细管电泳-质谱联用技术简介
5.1.1同轴液体鞘流
5.1.2无鞘接口
5.1.3液体连接
5.2.1阳离子代谢物CE-MS分析方法
5.2.2阴离子代谢物CE-MS分析方法
5.2.3多价阴离子代谢物CE-MS分析方法
5.3毛细管电泳在代谢组学中的应用研究
5.3.1微生物菌株细胞提取物的代谢分析
5.3.2植物细胞提取物的代谢分析
5.3.3疾病诊断和生物标志物发现
5.3.4食品安全
5.3.5细胞基因和蛋白质功能研究
参考文献
核磁共振在代谢组学研究中的应用
6.1核磁共振波谱分析原理
6.1.1核磁共振概论
6.1.2核磁共振波谱仪
6.1.3核磁共振氢谱
6.1.4核磁共振碳谱
6.1.531P及15N核磁共振
6.2代谢组学中的核磁共振波谱分析方法
6.2.1样品的准备
6.2.2实验数据的获得
6.2.3数据分析
6.3核磁共振在代谢组学研究中的应用
6.3.1在药物毒理学评价研究中的应用
6.3.2在人体代谢和动物代谢研究中的应用
6.3.3在病理和生理研究中的应用
6.3.4在环境监测方面的应用
6.3.5在植物化学研究中的应用
6.3.6在微生物系统研究中的应用
6.4展望
参考文献
代谢组学研究中常用的化学计量学方法
7.1数据预处理方法
7.1.1原始数据矩阵的获得
7.1.2自变量筛选
7.1.3数据的标度化及滤波
7.2常用的模式识别方法
7.2.1无监督的模式识别方法
7.2.2有监督的模式识别方法
7.3数据库及专家系统
参考文献
类脂和类脂组学
8.1类脂分子的结构和功能
8.1.1非极性类脂
8.1.2极性类脂
8.1.3类脂代谢物
8.2类脂的分子生物学
8.2.1表面化学和界面催化
8.2.2膜类脂分子是信号转导分子的前体
8.2.3类脂-蛋白质相互作用
8.3类脂研究中的分析方法
8.3.1类脂的提取方法
8.3.2类脂的分析方法
8.4ESI-MS在类脂分析中的定量方法
8.4.1内标化合物的选择
8.4.2MS在定量分析类脂分子中存在的问题
8.4.3ESI-MS在类脂研究中的定量方法
8.5类脂组学及其应用
8.5.1类脂组学
8.5.2类脂组学中类脂分子识别的策略
8.5.3基于质谱技术的几种类脂组学方法
8.5.4类脂组学在微生物研究中的应用
8.5.8类脂组学在功能研究中的应用
8.5.9类脂组学在药物滥用研究中的应用
8.5.10与类脂组学相关的数据库
小结
参考文献
9.1引言
9.2代谢组学用于心血管疾病严重程度的诊断
9.3.1代谢物的靶标分析
9.3.2顺二醇类代谢物的轮廓分析
9.3.3潜在标志物的寻找
9.4代谢组学用于恶性肿瘤的研究
参考文献
修饰核苷在癌症诊断和随访中的应用
10.1概论
10.1.1癌症诊断的方法概况
10.1.2肿瘤标志物的概况
10.1.4修饰核苷作肿瘤标志物的可行性
10.2体液中修饰核苷的分析和数据处理
10.2.1体液中修饰核苷的分析
10.2.2多变量可视化数据分类的方法
10.3.1尿中修饰核苷分布模式的建立
10.3.5化疗对尿中核苷排放水平的影响
10.3.6尿中核苷作肿瘤标志物实际应用范例
参考文献
……
代谢组学在糖尿病研究中的应用
代谢组学在营养学研究中的应用
代谢组学与药物研究
代谢组学在植物研究中的应用
代谢组学在微生物学中的应用
代谢组学在环境科学中的应用
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