东京街头接连出现火星人、倒立机器人等诡异身影，它们留下“一起去月球旅行”的纸条，背后是自称“电人Ｍ”的神秘反派在作祟。电人Ｍ以月球世界游乐项目为掩护，暗中觊觎化学家远藤博士的惊天发明。他伪装成博士助手潜伏，绑架博士之子治郎要挟，还利用机关、幻术制造多起密室消失案。少年侦探团的小林、小不点等人循迹追查，闯入地下电力王国，却遭遇火星人围攻、移动地板等多重陷阱，而电人Ｍ的真实身份与博士那足以颠覆世界的发明，还藏着更深的秘密。